با آغاز جنگ تحمیلی ۱۲ روزه، در نخستین گام، مدیریت خوابگاه‌های دانشجویی و بازگشت دانشجویان به منازل با برنامه‌ریزی دقیق انجام شد و تمهیدات لازم برای تعویق امتحانات اتخاذ گردید. همزمان، ستاد مدیریت بحران دانشگاه تشکیل شد و اقدامات ضروری در حوزه پدافند غیرعامل و حفاظت از داده‌ها و اسناد مهم دانشگاه به اجرا درآمد.

کارگروه‌های تخصصی برای مشاوره به ستاد مدیریت بحران استان ایجاد شدند و تولید محتوای تخصصی درباره ابعاد مختلف جنگ در دانشگاه آغاز شد. اعضای هیئت علمی دانشگاه، با حضور در صدا و سیما، شبکه‌های اجتماعی و سکوهای مجازی، به تبیین ابعاد جنگ و یادآوری نکات ضروری در راستای تقویت همبستگی ملی پرداختند.

همچنین، مکاتباتی از سوی دانشگاه و اعضای هیئت علمی دانشگاه ایلام با دانشگاه‌های خارج از کشور انجام شد که در آن، ضمن محکومیت اقدامات رژیم صهیونیستی، به شفاف‌سازی درباره نقش این رژیم در به شهادت رساندن دانشمندان ایرانی پرداخته شد.